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遐想HPC落地中科院遗传发育所,为基因组说明测序提供高机能计较平台

发布时间:2018-09-26 12:49:07 所属栏目:业界 来源:51CTO
导读:【新品产上线啦】51CTO播客,随时随地,碎片化进修 【51CTO.com原创稿件】技能的成长敦促了行业应用的落地,基因组学等组学研究正在改变人类的将来。 在上周对中科院遗传发育所基因组说明平台首席技能专家梁承志传授的采访中,他汇报记者,高伟大性、高不确
【新品产上线啦】51CTO播客,随时随地,碎片化进修

【51CTO.com原创稿件】技能的成长敦促了行业应用的落地,基因组学等组学研究正在改变人类的将来。 

在上周对中科院遗传发育所基因组说明平台首席技能专家梁承志传授的采访中,他汇报记者,高伟大性、高不确定性和高维度是说明生物数据时面对的最大坚苦。大量的数据和伟大的计较,假如没有高机能的计较集群支撑,是基础无法实现数据说明的。正是因为计较力的大幅晋升,才使得基因组说明得以高速成长。梁承志传授夸大,十年前做尝试也许要耗费一年,此刻仅必要一个月可能一周,乃至偶然辰一两天就完成了,这是尝试技能成长带来的数据发见服从的晋升。而这种大局限的数据也能获得实时说明,就是IT技能带来的服从晋升的最直接示意。 

大幅晋升的计较力,敦促了基因组学及相干学科的高速成长

计较力的大幅进步促进了基因测序财富的高速成长。相干数据统计,基因测序从2001-2013年复合增添率为33.53%,环球市场局限2007年只有800万美元,而2018年将到达约117亿美元,这组数据充实声名基因测序市场已经逐渐成熟。 

反之,行业应用的落地也同样加快了HPC市场的高速增添。相干数据表现, 2015-2019年时代,存储部门的增添率最快,为9.4%,其次中间部门增添为7.8%,处事器和应用部门的市场增添速度为7.7%,处事部门的增添速度为6.7%。这组数听声名, HPC与数据说明相团结的模式,已经备受业界所存眷。 

据梁承志传授先容,基因组学和生物信息学的研究方针就是要理会基因组,把基因组里的信息理会出来,对技能的依靠性长短常高的。他暗示,每小我私人,每个作物都有遗传物质,通过基因组一代一代传下去,重要的信息都在基因组里。另外,除了遗传信息之外,还涉及整个生物体,就像人的各类组织,各类器官,各类代谢进程和生化途径,各类机理一样,很是伟大。通过对这些伟大数据的说明,就可以或许找到一些纪律和一些新常识,并用这些常识来指导我们的一般糊口。 

以小我私人基因组测序为例,今朝100GB是最根基的数据量,将来跟着组学技能的进一步打破,种种数据总和有也许到达1TB。如果把地球上全部人的数据都网络完成,这个数据量将高出今朝地球上全部数据的总量。梁承志传授夸大,生物大数据是真正发作式增添的大数据,对集群的计较要求会越来越高,没有高机能的计较集群,这项事变基础就没法开展,这也是中科院遗传发育所选择遐想HPC的首要缘故起因。 

遐想HPC平台,为中科院遗传发育所基因组说明提供计较保障

一向以来,遐想与中科院保持着较量细密相助。据遐想数据中心营业团体中国区方案营销总监李炜先容,高机能计较降生后的第一个基本应用就是科研规模,中国科学院作为中国独一的官方国际级科研院所,下设差异的所、科研单元很是多。遐想很早就与中国科学院有很是深度的相助,仅仅客岁就与中科院的9个研究所举办了相助。其它,遐想开拓的全天下第一套万亿次的集群,也是遐想第一个代表中国入驻天下500强的第一套集群,就与中科院收集中心举办了相助陈设。 

李炜暗示,遐想通过优化大数据说明平台的软硬件架构为中科院遗传发育所基因组说明提供计较保障,成立很是好的相助相关,辅佐他们更快的晋升大数据的说明手段,在基因组说明方面取得更大的盼望。

谈到两边相助,遐想数据中心营业团体中国区当局行业贩卖总监邰能波暗示,遐想有着国际化的团队,我们通过在数学,出格是数学计较、遗传、物理、情景等规模里的专项算法开拓,对计较集群举办全面优化,大幅晋升了基因测序和科学计较的数据说明服从,为中科院遗传发育所基因测序工程高效完成各类数据说明事变,奠基了精采的计较基本。 

不绝优化的高机能计较平台,为各行业一连赋能

作为环球排名第一的高机能计较厂商,遐想在高机能计较平台的研发上有着行业领先的技能气力。 

遐想不只是一个基本架构办理方案的提供商,更有着强盛的硬件手段,并且开拓了集群调优并行软件,担保了集群服从的最高。李炜汇报记者,在高机能集群最早降生的时辰,最大的技能挑衅是并行集群放在一路计较手段的消费。简朴而言,计较的时辰不能做到一加一便是二,会有能量的消费。一个计较节点是两万亿次,一百个节点不行能做到两百万亿次,而计较力的转化,就必要强盛的软件调优手段。 

为了打造最优越的平台,遐想在环球专门设有三个HPC研发中心,别离是北京、斯图加特和莫里斯维尔;为了办理行业应用困难,遐想在每个规模都请到了环球闻名的行业专家等,目标就是相识差异行业对计较力的差异需求,有针对性的举办算法优化,为它们提供最强机能的计较平台。 

在HPC上的恒久投入,让遐想进入了环球超算的第一梯队,在2018/2019财年第一季度,遐想成为环球最大的TOP 500高机能计较机平台提供商,约莫每四套体系中就有一套来自遐想(23.4%)。从最新一期的环球高机能计较TOP 500榜单数据表现,从数目来看,遐想高机能计较机排名第一。 

除此之外,通过在教诲、制造等行业规模的深度相助,遐想也蕴蓄了富厚的陈设履历和拭魅战案例,由遐想辅佐南京大学搭建的超算中心,更是以每秒870万亿次的计较峰值和高出79.62%的运算服从,成为了今朝海内高校顶尖的超算中心之一。 

可以说,在环球数字化转型要害时候,遐想依附着在HPC上的深挚蕴蓄,助力于辅佐企业加快推进AI、大数据等应用的落地,为行业向着伶俐化迈进,夯实了基本,提供了动力。

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(编辑:湖南网)

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