基因界谷歌 | 中国人本身的生命大数据平台，来了！

编者按

5 月 27 日，生命大数据岑岭论坛暨第四届基因组云计较技能开拓者峰会（GCTA 4）在贵阳谨慎进行。作为 2019 数博会的重要构成部门，集会会议聚焦“阅读、打点、领略、计较生命大数据”，分享前沿学术陈诉，解读最新政策及行业动态，为生命大数据的研究与应用再添新动力。

环绕怎样搭建生命应用大平台，魏晓锋分享了国度基因库生命大数据平台（CNGBdb）的计划思绪及处事上风，并展示了 CNGBdb 在助力生命大数据研究与应用方面取得的成就。以下是内容详情。

生命大数据，发掘种质资源

生命就是大数据，其载体也许是动物、植物，也有也许是细胞，乃至磁盘或磁带。这里涉及一个要害词：种质（编者注：种质是指生物体亲代转达给子代的遗传物质，每每存在于特定品种之中。 如迂腐的处所品种、新培养的推广品种、重要的遗传原料以及野生近缘植物，都属于种质资源的范畴）。

哪些种质的应用对经济有较大代价？中国的种质资源富厚到什么水平？对付富厚的种质资源，应该怎样做好信息存储？

其它，每小我私人都是一个行走的大数据库。每小我私人从受精卵生长及至朽迈，整个身材里动态维持着 40 多万亿细胞，每个细胞里都有 23 对染色体。IT 规模常常提到一个词叫量级，晋升一个量级必要常常更新要领。而在 BT 规模的困难是，我们每小我私人有 3G 的基因组数据，通过测序说明会发生数百 GB 乃至 1TB 以上的数据。海量数据对平台和要领有更严苛的要求。

搭建数据组织的顶层计划

面临错乱的数据，CNGBdb 团队把自身的数据和果真的信息举办了整合。那么，如安在上层构建一个新的载体以组织毗连？魏晓锋以为，在这个平台上，必要做三件工作：数据、体系、收集。

详细到数据。CNGBdb 构建了一个数据客栈，整合了表里部的数据，成立尺度流程，全部的数据都以节点的情势来承载。

另外尚稀有据发掘。整个平台被分成数据层、平台层、应用层。将来，用户如需建设数据应用，只需一个按钮，就能像做选择题一样选择相干模块。

对应到收集，作为一个平台，并不是一个孤傲的数据点。CNGBdb 整合了环球的果真生命数据资源，包围母婴康健、肿瘤、动植物多样性、病原微生物等十几个研究规模，形成一个超大型的科研数据体系。

CNGBdb，打造基因界的谷歌

CNGBdb 的主页界面

魏晓锋先容，CNGBdb 今朝已经成立包围康健与疾病、生物多样性、微生物等规模的十大专稀有据库，专精专用；支撑数十篇科研成就颁发，被《Cell》《Nature Genetics 》《Nucleic Acids Research》等国际期刊引用；并通过样本信息共享平台（E-BioBank）对外共享相干信息，并且配有对应的标本照片。

可以说，CNGBdb 以同一派其它情势，为用户一站式办理搜、存、算、用所有需求，且对用户免费开放，全力打造“基因界的谷歌”。

CNGBdb 一站式办理搜、存、算、用所有需求

另外，依托国度基因库对生物数据的“存”、“读”、“写”联动，CNGBdb 将样本元数据与生物样本乃至活体信息相干联，因此数据可以在“生物活体——生物样本——生物信息数据”全进程中举办追溯，实现综合数据的全贯串。

魏晓锋称，从开始的“载体”到“毗连”，再到最后以“平台”的情势展示，CNGBdb 作为一个对外的窗口，展示了数据的也许性。其它，就处事体验而言，CNGBdb 更但愿做成一本字典，让全部人通过这个字典都可以利便快捷地相识到更多更富厚的信息。

将来，CNGBdb 将一连促进生命大数据的共享与操作，使生物信息数据在生命科学与生物财富成长中缔造更大代价。

（编辑：湖南网）

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