科学家首次实现对新冠病毒RNA直接测序
澳大利亚墨尔本大学微生物和免疫学系的Lachlan Coin和Sebastian Duchene团队及相助者,提供了新冠病毒的第一个直接RNA序列,具体先容了该冠状病毒亚基因组长度的mRNA布局,并描写了从共享数据中显现的冠状病毒进化遗传学的各个方面。相干论文3月7日宣布于预印本处事器bioRxiv(bioRxiv全部论文未经偕行评议)。 新冠病毒是一种冠状病毒科阳性单链RNA病毒,与能传染哺乳动物和禽类宿主的乙型冠状病毒相干,譬喻MERS冠状病毒和SARS冠状病毒。 为了确定新冠病毒亚基因组长度的mRNA的布局,研究职员行使了一种最近成立的基于高度平行纳米孔阵列的直接RNA测序要领。简而言之,从具有高程度新冠病毒的作育原料中制备出核酸,并在GridION平台长举办测序。 通过这种要领,新冠病毒样本在40小时的测序中发生了680347个读数,包括了860Mb的序列信息。与作育的新冠病毒疏散株的基因组同等,部门读数属于冠状病毒序列(28.9%),包罗漫衍在29893个碱基基因组中的367Mb序列。个中一些长度高出2万个碱基,研究职员还捕捉了单个分子上的大部门基因组。 通过数据说明,研究职员确定了42个具有可猜测的5—甲基胞嘧啶修饰的位点,这些位点在亚基因组长度的mRNA之间泛起同等的位置。 在其他阳性单链病毒中,RNA甲基化在传染进程中会产活跃态变革,影响宿主—病原体彼此浸染和病毒复制。一旦数据集可用于新冠病毒的直接RNA序列,研究职员也许会发明其他的修饰。人们今朝对冠状病毒的表观转录组修饰知之甚少。 研究职员以为,通过行使直接的RNA序列数据,有助对新冠病毒分子生物学的深入相识,并也许辅佐构建病毒亚基因组长度mRNA布局的具体视图。(唐一尘) (编辑:湖南网) 【声明】本站内容均来自网络,其相关言论仅代表作者个人观点,不代表本站立场。若无意侵犯到您的权利,请及时与联系站长删除相关内容! |